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全基因組測(cè)序
來源：萬物生物 發(fā)布時(shí)間：2021-11-02
全基因組測(cè)序
全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序。 1986年， Renato Dulbecco是最早提出人類基因組測(cè)序的科學(xué)家之一。他認(rèn)為如果能夠知道所有人類基因的序列，對(duì)癌癥的研究將會(huì)很有幫助。美國能源部（DOE）與美國國家衛(wèi)生研究院（NIH），分別在1986年與1987年加入人類基因組計(jì)劃。除了美國之外，日本在1981年就已經(jīng)開始研究相關(guān)問題，但是并沒有美國那樣積極。到了1988年，詹姆士·華生（DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)者之一）成為NIH的基因組部門主管。1990年開始國際合作。1996年，多個(gè)國家召開百慕達(dá)會(huì)議，以2005年完成測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)，分配了各國負(fù)責(zé)的工作，并且宣布研究結(jié)果將會(huì)及時(shí)公布，并完全免費(fèi)。
應(yīng)用領(lǐng)域
(1) 全基因組范圍內(nèi)多性狀的定位；
(2) 目標(biāo)性狀的生物學(xué)基礎(chǔ)研究。
產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
(1) 高通量檢測(cè)全基因組SNP并進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，掃除定位盲點(diǎn)；
(2) 重重篩選SNP，多重檢驗(yàn)顯著性，保證結(jié)果準(zhǔn)確性；
(3) 同時(shí)對(duì)多種性狀進(jìn)行定位；
(4) 定位精度最多可達(dá)單基因水平。
標(biāo)準(zhǔn)信息分析
(1) 已有參考基因組序列的動(dòng)植物自然群體；
(2) 樣本間無明顯的亞群分化（如生殖隔離等）；
(3) 所研究表型性狀遺傳力較強(qiáng)。
(4) ≥200個(gè)樣本；
(5) 基于SNP：≥5 X/個(gè)體；
(6) 基于CNV：≥30X/個(gè)體 10~20W Tags；
(7) 平均8 X/Tag；
(8) 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估；
(9) 與參考基因組比對(duì)；
(10) SNP、CNV檢測(cè)及注釋 SNP檢測(cè)及注釋；
高級(jí)信息分析
(1) 構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹；
(2) 群體主成分分析；
(3) 連鎖不平衡分析；
(4) 性狀關(guān)聯(lián)分析；
(5) 目標(biāo)性狀相關(guān)區(qū)域基因功能注釋；
(6) 構(gòu)建單體型圖譜。
樣品要求
(1) 樣品類型：基因組DNA；
(2) 樣品需求量：單次2 ug；
(3) 樣品濃度：文庫≥30 ng/μl；
(4) 樣品純度：OD260/280為1.8-2.0；
(5) 電泳要求：主帶清晰，無降解或輕度降解。（距送樣日最近的電泳結(jié)果）
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標(biāo)書基金實(shí)驗(yàn)咨詢 表觀遺傳組學(xué)分析
課題實(shí)驗(yàn)結(jié)題指導(dǎo) 細(xì)胞分子功能驗(yàn)證
實(shí)驗(yàn)培訓(xùn)文章潤色 動(dòng)物模型裸鼠成瘤
臨床檢測(cè)科研轉(zhuǎn)化 病理染色分子互作