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全基因組甲基因測(cè)序

來源:萬物生物   發(fā)布時(shí)間:2021-11-02

全基因組DNA甲基化測(cè)序

全基因組DNA甲基化測(cè)序(Whole Genome Bisulfite SequencingWGBS)是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)相結(jié)合,對(duì)有參考基因組的物種在全基因組水平進(jìn)行高精準(zhǔn)甲基化研究。WGBS可以達(dá)到單堿基分辨率,精確分析每一個(gè)胞嘧啶的甲基化狀態(tài),從而構(gòu)建精細(xì)的全基因組DNA甲基化圖譜。

基于全基因組重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化的WGBS法,實(shí)現(xiàn)單堿基分辨率的甲基化位點(diǎn)精準(zhǔn)、高效定位。精準(zhǔn)獲得全基因組甲基化的C位點(diǎn),是甲基化測(cè)序的金標(biāo)準(zhǔn);全面分析不同處理對(duì)全基因組甲基化水平的影響,快速準(zhǔn)確地找到差異甲基化區(qū)域。具有高效、精準(zhǔn)、超值的優(yōu)勢(shì),已廣泛應(yīng)用于人和動(dòng)植物研究。

 

WGBS

分析內(nèi)容

解決問題

標(biāo)準(zhǔn)分析

測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估

過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù),保證數(shù)據(jù)質(zhì)量

與參考基因組比對(duì)

比對(duì)率和覆蓋度分析

甲基化位點(diǎn)calling

分析甲基化位點(diǎn)

甲基化分布

甲基化在基因組,染色體,功能元件上的分布

差異甲基化分析

尋找DMR

相關(guān)基因分析

相關(guān)基因GOKEGG富集分析

多樣本分析

PCA分析多樣本甲基化變化規(guī)律

 


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